高效皇帝
朱祐樘與父親朱見深有一個相同點，就是善於耐心聽取別人的意見。但倆人的不同點是，朱見深經常只聽不做，朱祐樘只要覺得對，就立刻做。
《明史》上對他記錄非常多的，就是他的“勤於納諫”，比如吏部尚書王恕要他把全國各地官員的名字貼在皇宮柱子上，以便隨時查閱，朱祐樘當天就貼上了。兵部尚書馬文升要朱祐樘節省宮廷開支，朱祐樘立刻下令，從當月的開支開始削減。禮部尚書丘浚給朱祐樘上《大學衍義補》，朱祐樘閱後很高興，立刻下令福建地區刻印，全國發行。外表溫和的朱祐樘，做事卻是個風風火火的人。
全面提速
朱祐樘執政時代，和父親朱見深相比，最大的差別就是效率。“弘治中興”時期，中央政府機構有明文規定，對已經熟悉的奏章，處理時間不能超過兩天，對不熟悉的奏章，處理時間不能超過三天。對需要不同部門聯合處理的奏章，處理時間不能超過十天。特別重大的軍機事件，處理時間最多寬限五天。朱見深在位時代人浮於事的局面，一度大爲扭轉。
愛護動物明孝宗
明孝宗朱佑樘的倆個公認優點，就是節儉和仁慈。但這倆個好品質放在一起，有時候卻也鬧雷事。比如他登基後，開始叫停朱見深時代的種種享樂活動，但有個事情犯了難：朱見深還留下了一些真禽猛獸，這些動物怎麼處理？喂着吧浪費糧食，殺了吧又太殘忍，放出去吧，還會傷害人畜，朱祐樘答：那就不給餵食，讓他們自己餓死好了。就這樣餓死？
奸臣辦好事
明孝宗用人，一個重要的特點，就是許多之前被看做奸臣的人物，在他的手下，反而成了能臣。典型如朱見深在位時期的佞臣劉吉，朱見深時代，他就是內閣大學士，除了善於排擠同僚外，他最主要的工作，就是逢迎拍馬。當時明朝官場上送他的綽號叫“劉棉花”，意思是臉皮厚，不怕罵。
明孝宗朱祐樘登基後，開始勵精圖治，劉吉搖身一變，經常上書建言國家大事。而看重他能力的朱祐樘，不但沒有清算他，相反留用他爲內閣首輔，他擔任首輔時，雖然也有打擊陷害言官等惡行，但最重要的貢獻，就是不費一兵一卒解決了哈密問題。
當時哈密被吐魯番侵佔，明王朝上下意見不一，劉吉提出了“閉關絕貢”的手段，即對吐魯番進行經濟封鎖，逼迫其主動交還哈密。事後果然奏效。他的功勞，也恰應了一句俗話：惡人自有惡人磨。
皇上給你錢
朱祐樘得到後世稱頌的，除了他的勤政與人品外，就是他對文臣的優禮。比如他極其信任的左都御史戴珊，弘治十八年(1405年)，朱祐樘接見戴珊時，特意贈給他一錠白銀。並解釋說：這一點錢，多少能夠表彰戴珊的廉潔。皇帝給臣子送錢，明朝並非首例，但僅爲表彰道德，確爲首例。戴珊晚年，多次請求退休，朱祐樘對戴珊說：我把天下大事交給你，就像對待家人一樣，而今太平盛世尚未實現，怎麼能說走就走呢？聞言的戴珊流淚說：我只有死在任上了。
丈母孃家不好惹
“中興之君”朱祐樘的政治污點之一，就是包庇外戚。他是中國歷史上僅有的兩位保持一夫一妻生活的皇帝之一。一生除了張皇后外再無嬪妃。
但物極必反，不但張皇后本人好奢華，張皇后的兩個哥哥——張延齡與張鶴齡，更成了弘治朝至正德朝一霸。朱祐樘曾不顧“祖制”約束，爲這哥倆在京城開商號，等於默許他們搞“官倒”。這哥倆的主要惡行，除了搶男霸女外，就是大肆圈佔土地。
對他們的行爲，朱祐樘有時候也採取一些啼笑皆非的處理方法：一次大理寺覈查土地，秉公處理了張家兄弟強搶民田的案子，張皇后聞訊大怒，跑到朱祐樘處哭鬧。結果朱祐樘耍起了“兩面派”，先在張皇后面前假裝生氣，斥責大理寺辦案不公，等着把張皇后哄高興了，趕快偷偷派太監去大理寺傳旨，內容很荒唐：這次覈查土地，你們做的對，每人賞白銀一百兩。但是我今天誇獎你們的事，一定一定要保密啊，千萬不能讓皇后知道啊。
