尹直等大臣此前也隱約聽說過這個皇子的存在，大家通過太監黃賜，請求憲宗皇帝公開這個祕密，不必隱瞞，否則將來無法讓天下人信服。明憲宗含糊地回覆說：“是有一個皇子在西內，具體的事，朕再打聽。”
顯然，憲宗皇帝還在裝糊塗。於是尹直打算再進一步，想請求皇帝爲這位皇子命名。後來擔心引發不測，終於沒有敢聲張。實際上，這件事只瞞着萬貴妃一個人，等到時機成熟了，太監張敏再通過萬貴妃宮裏的太監段英，將消息透露給萬貴妃。萬貴妃如聞霹靂，吃驚地問：“爲什麼單單瞞着我一個人?”
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到了這種地步，接受現實才是最明智的做法。萬貴妃是何等聰明的人物，當然清楚這一點，她馬上換好禮服，趕去祝賀憲宗皇帝。憲宗皇帝高興，也暗暗出了一口氣，因爲他不必再裝下去了，下令厚賜紀氏母子，挑選一個好日子，把母子二人請入宮中。《謇齋瑣綴錄》的說法雖然不像《明史》那樣有戲劇性，但更合乎事理，更經得住推敲。
成化十一年五月十九日，明憲宗給禮部下了一道手諭，要求給六歲的皇子起名字。禮部擬了“福、楷、棨、榘”四個字，明憲宗都認爲不好，最終改爲朱祐樘。大臣們希望立他爲皇太子，明憲宗認爲他還太小，長一長，多讀一些書，再立不遲。朱祐樘命名之後，明憲宗帶着他出來與大臣們相見，在文華殿召見大臣們的時候，也讓朱祐樘陪伴。文淵閣大學士商輅在與明憲宗單獨對話的時候，請求皇帝注意保護皇子。大臣們原本想提出皇子與紀氏同住一宮，以免發生意外，只是擔心激化矛盾，沒有當面提出來。
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朱祐樘露面之後，他的母親紀氏仍然住在西內。商輅擔心她會出事，卻又不能明說，就和幾位大臣一起嚮明憲宗建議說，皇子聰明，皇子的母親因病住在別處，不太妥當，應該讓她與皇子住在一起，母子朝夕相處纔好。
明憲宗答應，紀氏就從安樂堂搬進永壽宮居住。紀氏與兒子分別時的預言是正確的，不久她就突然生病，太監黃賜和張敏帶着幾位御醫前去診治，第二天病勢減輕，到了六月二十八日突然死去。據說，當天天色赤紅，憲宗皇帝追封紀氏爲紀淑妃。
關於紀淑妃的死因，傳言紛紜。一種說法是萬貴妃害死了她，另一種說法是自縊而亡。她一直信賴和依靠的太監張敏也吞金而死。
不久，商輅又提到皇太子的事，說：“陛下登基已經十年，皇儲之位一直空虛，現在應該立皇子爲皇太子，以安定人心。”
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明憲宗點頭，成化十一年十一月，朱祐樘被立爲皇太子，大赦天下。任命商輅爲太子少保、吏部尚書。朱祐樘被立爲皇太子，皇太后擔心他遭人暗算，要求把太子交給自己撫養，於是皇太子住進仁壽宮。有一次萬貴妃請皇太子過去吃飯，皇太后囑咐孩子，去了以後什麼東西都不要吃。萬貴妃見了皇太子，拿出食物給他，皇太子說自己剛剛吃飽了。萬貴妃再給他羹湯，皇太子搖頭說：“害怕有毒。”
萬貴妃大怒，說：“這個孩子，小小年紀就這樣對我，將來做了皇帝，會把我吃了。”此時的朱祐樘是皇太子，萬貴妃雖然生氣，卻不敢拿他怎麼樣，氣得大病一場。
萬貴妃管得住妃嬪、宮女，卻管不住皇帝。漸漸地，像朱祐樘一樣僥倖活下來的皇子越來越多，宮中依附萬貴妃的太監們也開始爲自己的未來擔憂，不敢胡來。成化二十三年，萬貴妃暴病而亡，明憲宗非常傷心，輟朝七天，並下令厚葬萬貴妃。
