清朝採用密摺制度，起於康熙，就是允許和鼓勵四品以上的中央和地方官員，直接向皇帝遞密摺。密摺制度的作用有兩個，一是使得朝政進一步黑箱化，增添皇權的神祕感。二是起到了使官員、尤其是同僚，相互告密的作用。比如一省之內，督撫、布政使、按察使、道臺都可以獨自上折密奏，那麼誰還有膽量揹着皇帝做不臣之事?密摺制度使得同僚變成了"特務"，誰都有打小報告的可能，自然是防不勝防，於是只好老老實實。三是大大提高了行政效率，皇帝對密摺的重視程度高，有着優先御覽的特權，真正實現了及時的下情上達。四是實行密摺制，等同於廣開言路，羣臣可以直言進諫，使大臣們相互牽制，加強了皇權。五是密摺奏事的權利只有得到皇上寵信的人才能享有，臣子們爲了獲取皇帝的信任，紛紛獻媚，進一步加強了君主專制。這裏有康熙四十三年七月二十九日，曹寅上了這樣一道摺子：
臣寅蒙皇上天恩，生全造就，雖捐糜難酬萬一。去年奉旨著與李煦輪管鹽務，今又蒙欽點臣寅本年巡視兩淮。臣寅聞命自天，惶悚無地，謹北向頂香九叩謝恩訖。念臣寅於雅歲備犬馬之任，曾無尺寸之效，愚昧稚魯，不學無術，蒙皇上念臣父璽系包衣老奴，屢施恩澤，及於妻子，有加無已。鹽政雖系稅差，但上關國計，下濟民生，積年以來委曲情弊，難逃皇上洞鑑。
臣寅擬星馳赴闕謝恩，恐駭物聽，八月上旬料理運務已畢，俟造冊報竣，仰求皇上俯準陛見謝恩，以申犬馬戀主之誠，得以披陳下悃，仰聆聖訓，祗遵敬恪，庶免覆束之患。謹具摺上奏，伏乞睿鑑施行。臣寅無任頂戴悚息激切屏營之至。
康熙在硃批中寫道：朕體安善，爾不必來。明春朕欲南方走走，未定。倘有疑難之事，可以密摺請旨。凡奏摺不可令人寫，但有風聲，關係匪淺。小心，小心，小心，小心，小心，小心，小心，小心……。
在這個摺子裏，曹寅再三再四地申明自己的奴才身份。更重要的是，他懇求康熙讓他進京面謝。“仰求皇上俯準陛見謝恩，以申犬馬戀主之誠，得以披陳下悃，仰聆聖訓，祗遵敬恪，庶免覆束之患。”我們不能認爲這份君臣之情是假的，兩人雖非同父，卻是一母所乳，又有同學之誼。感情沒有任何可以懷疑之處。在曹寅是感恩不盡，在康熙是關懷備至。
康熙不讓他進京謝恩，認爲這沒有必要。而且透露轉年，即四十四年有可能還要南巡，到那時再見不遲。意思是還有見面的機會，但不是在北京。
“小心”二字暴露了他不讓曹寅來京的真實目的。
在這個御批裏，我們很容易地看到康熙的謹慎，甚至是緊張。他在處處保護曹寅，生怕出什麼閃失。康熙最不放心的，是自己身邊和曹寅身邊的身份複雜的人。所以，才叫曹寅加十二分的“小心”。“小心”什麼?一是江南一帶的復明勢力，二是，關於太子及太子黨們的動向。而後一種“小心”似乎份量更重。
朝廷，正如《紅樓夢》裏的賈府一樣，表面特別安定詳和，內裏卻充滿矛盾和殺機。有人說襲人是賈母、王夫人安插在大觀園的密探，那麼，賈雨村等清客何嘗不是朝廷安插進賈府的密探?曹寅就是康熙安插在江南的密探，他在那裏偵察，也要在那裏反偵察。
在密摺制對加強皇權有着積極作用的同時，也存在不少消極的作用。一是皇帝要廣大臣僚用密摺言事 , 其本身就具有鼓勵臣下告密之意。這種專制制度扼殺人的主觀能動性和創造性 , 扼殺新生事物的成長。當時除了雍正的少數幾個心腹大臣稍敢勇於任事外 , 廣大臣僚都人人自危 , 斤斤自保。二是衆多臣僚用密摺言事 , 所言內容彼此都不得而知 , 某人即使被誣陷也無處申訴 , 再加上雍正與衆臣僚的關係親疏不一 , 有人自恃與雍正關係較密 , 藉以挾持上司或他人。三是廣大臣僚可以用密摺越級言事 , 必定會引起上下猜疑 , 不利於政務的推行 , 這也不符合層層負責的科學管理思想。
總之，清朝的密摺制度說到底就是一種特務統治，是一個異族入主中原的內心恐懼和強烈的不自信，這種特務統治，是封建帝王的御人之術，使君臣之間離心離德，同僚之間相互猜忌，上下之間陽奉陰違，嚴重地阻礙了帝國的政令暢通和制度上的創新發展，所以有清一朝，朝堂之上滿眼皆是奴才，舉國之民皆抽去了脊樑，這對中華民族的人性塑造是一次很大的摧殘，也正是其國祚式微的根本所在，試想一個不具包容、不具有海納百川的胸襟氣度和民族自信的人怎麼可以統御華夏?試想一個固步自封、目光短淺又夜郎自大的人怎麼可以治理好泱泱大國?最終這個愛新覺羅氏家族在歷史的長河裏帶給中華民族的只是歷史的災難和人性的泯滅。
