1588年第一次無敵艦隊遠征
西班牙無敵艦隊(Spanish Armada)，字面意思是“偉大而幸運的海軍”，爲了報復伊麗莎白對瑪麗的處決，腓力二世誓言要入侵英國，並將一名天主教君主取而代之。他組建了大約130艘艦船組成的艦隊，包括8,000名士兵和18,000名水手。爲了籌資這項計劃。教皇西克斯圖斯五世允許腓力二世徵繳遠征稅。教皇承諾，如果他們能到達英國本土，將對西班牙軍隊進一步補貼。他們於1588年5月28日無敵艦隊駛往尼德蘭。在那裏爲入侵英國而增派軍隊。然而英國海軍使無敵艦隊在格拉沃利訥海戰失利，並迫使無敵艦隊向北航行，在蘇格蘭附近海域，遭到了使艦隊和人員受到嚴重損害的暴風雨天氣。無敵艦隊的失敗，爲英國水手提供了寶貴的航海經驗。而英國人能夠堅持私掠船行爲反抗西班牙，並繼續派遣部隊援助腓力二世的敵人荷蘭和法國。這些努力帶來了一些切實的回報。該事件最重要的影響之一是，無敵艦隊的失敗被視爲上帝支持英國新教改革的一個標誌。
第二年，英國也組織了類似的大規模遠征行動，即科倫納·里斯本遠征，但卻是不成功的，給英國經濟造成嚴重的損失和人員及艦船的慘重損失。
1591年弗洛雷斯之戰
這是英西戰爭期間的一次重要戰鬥。這是英國的托馬斯·霍華德率領的22艘軍艦和西班牙的阿隆索·德·巴桑率領的55艘軍艦在弗洛雷斯發生的戰鬥。英國的艦隊被派往亞速爾羣島捕獲一年一度的西班牙珍寶船隊。當在弗洛雷斯島發現一支更強大的西班牙艦隊時，托馬斯·霍華德命令他的船隻逃向北方，以保存實力。除了格倫維爾和他乘坐的“復仇”號。
深孚衆望的驍將格倫維爾戰死和身經百戰的“復仇”號沉沒，在英格蘭引起軒然大波，種種謠言和傳說不脛而走，後來，沃爾特·羅利根據參戰的指揮官和部分船員的意見，發表了正式報告書之後，輿論和謠傳才漸漸平息下去。雖然伊麗莎白女王對於格倫維爾壯烈犧牲深感悲傷，但是她畢竟是一個現實主義者，表面仍保持冷靜態度。英格蘭國民非常讚賞和敬仰格倫維爾和“復仇”號的船員們，把他們譽爲蒂爾莫皮來山頂與波斯殊死作戰的斯巴達勇士。
這次戰鬥標誌着西班牙海上力量的復興。並證明英國捕獲和擊敗西班牙珍寶船隊的機會已經遙遙無期。
1596年第二次無敵艦隊遠征
1595年，卡洛斯·德·阿梅斯基特率領小船隊(4艘加里昂船和小型帆船編成)襲擊了布列塔尼半島的幾個漁村之後，被逆風吹過海峽到了錫利羣島附近海域。爲了補充淡水，船隊悄悄駛近康沃爾。西班牙船如此大膽地駛近英格蘭本土之舉，是前所未有的勇敢行動。大約兩個月前，因爲西班牙船偶爾接近了海峽沿岸，引起康沃爾郡和德文郡沿海港口的警惕，從而加強了防衛體制。
這隻小船隊中乘有英格蘭逃亡者，使得阿梅斯基特對康沃爾郡瞭如指掌，毫不猶豫地決定在利澤德角的芒茨灣和毛斯霍爾登陸。登陸的二百餘名西班牙士兵對毛斯霍爾及周圍村鎮和教堂肆意燒殺搶掠，還在小山崗設崗放哨。隨後阿梅斯基特率領船隊繼續北上，命令士兵登陸，攻佔彭贊斯城，把該城燒殺一空。當地統監弗朗西斯·戈德芬認爲，西班牙人此舉是發動全面進攻的先兆。於是，一面緊急使到普利茅茨報告軍情，一面召集民兵準備反擊，但是當地居民早已驚慌失措爭相逃命，誰也沒有理睬他的命令。400名西班牙士兵在彭贊斯西邊的小山上舉行了彌撒，發下誓願征服英格蘭之後，一定在那裏修建一座修道院。得悉德雷克和豪金斯的艦隊從普利茅斯起航的消息之後阿梅斯基特忙不迭地下令撤退，利用順風返回布列塔尼半島。
腓力二世接到西班牙軍隊破天荒第一次在英格蘭本土登陸的報告後，發現英格蘭人的防衛和抵抗出人意外的脆弱，決定把遠征的目標集中在英格蘭本土上。
1596年上旬的一天夜裏，在埃爾埃斯科里亞爾修道院國王簡樸的書齋裏，腓力二世及其重臣們慎重地分析並討論了愛爾蘭問題，決定派遣無敵艦隊進行第二次遠征，目標愛爾蘭，同英格蘭艦隊進行決戰的可能性甚小。因此，無需籌建強大的艦隊，只要對愛爾蘭西北岸的斯萊戈或西岸的戈爾韋作一次航海，就可以運送愛爾蘭所需的軍隊和軍需品。無敵艦隊完成護航任務後，立即返航回國，待到冬季來臨，再從拉科魯尼亞等港口定期爲愛爾蘭補給。第二年夏天，當英格蘭我愛爾蘭舉國上下的天主教徒的大起義而窮於應付、疲於奔命之時，再派無敵艦隊進行第三次遠征，目標英格蘭本土。這就是腓力二世派遣第二次無敵艦隊遠征的全盤戰略構思。
無敵艦隊以令人吃驚的速度在加的斯北邊的生盧卡爾港和里斯本港集結，出發日期定在10月下旬。新的無敵艦隊由百餘艘大小戰船組成。其中主力是包括“12門徒”在內的30艘加里昂船。預定運載集結在西班牙和荷蘭的9000名西班牙士兵和3000名葡萄牙士兵，途中再從法蘭西的洛里昂港增補若干士兵。這支艦隊雖然是前後5支無敵艦隊中規模最小的，但爲這次遠征所籌措的糧食和軍需品數量卻非常浩大。
而英國在1595年從法國撤出軍隊後的三年裏，又發動了三次與西班牙的大規模海上戰爭。首先出臺的是德雷克的美洲冒險計劃。這一計劃遭到德雷克等人的強烈反對，他們聲稱，如果計劃改變，女王將負擔一切費用，包括船隻、供應、步兵和水兵的薪餉。女王不得已於8月批准德雷克的計劃，船隊由6艘王家船隻和13艘商船組成，女王負責2/3費用，其它由總指揮德雷克和霍金斯及支持者承擔。由於德雷克與霍金斯間的爭吵以及德雷克指揮上的失誤，遠航沒取得任何收穫，兩人都病死在途中。
1596年6月初，英國又一支規模空前的遠征船隊出航，吸取第一次無敵艦隊入侵前德雷克奇襲加的斯破壞無敵艦隊部署的經驗，再次對籌建中的無敵艦隊以先發制人的攻擊，是英格蘭遠征軍的主要目的。但是，像以前一樣，剛來到海上，指揮官們又開始自作主張。他們的首要目標是進攻加的斯港城。佔領加的斯後，幾乎所有官兵都忙於搶劫，女王的戰略目的被拋在腦後。不過西班牙在此役中的損失是無法估量的，但是，加的斯的慘敗和恥辱，反而激發了西班牙人的鬥志。因此，資金從各地城鎮和教會陸續送到了馬德里。在宮廷、貴族、僧侶、農民中，不惜代價，派遣新艦隊遠征英格蘭的呼聲很高。西班牙全國民情激憤，鬥志昂揚。
1596年10月下旬，腓力二世乘英國海防空虛之機派出第二支無敵艦隊進攻英國。但是，這支船隊在比斯開灣遭到秋季颶風的襲擊損失慘重。剩餘船隻被迫回到費羅爾港。形勢再次回到1588格瑞弗蘭海戰後的樣子。而英國像那時一樣，伊麗莎白和財政大臣威廉·塞西爾把消滅其殘餘視爲頭等大事。1597年夏，又一支英國遠征隊組成。然而遠征指揮官們仍把獲取利潤作爲首要目的，直接駛向亞速爾。這次遠征失敗後，伊麗莎白結束了官方參與的海上冒險活動。同時命令艦隊今後不得離開本國沿海海域。針對新教徒使用私掠船攻擊西班牙和葡萄牙的商船行爲，西班牙君主通過敦刻爾克私掠船發起反擊造成新教徒航運的慘重損失。
1597年第三次無敵艦隊遠征
第二次無敵艦隊遠征的夭折，絲毫沒有動搖腓力二世向英格蘭復仇的堅強決心，他立即下令在里斯本和拉科魯尼亞兩港迅速着手籌備第三支無敵艦隊。總司令帕德拉立即全力以赴地投入了緊張而又細緻的籌建工作，以免重蹈前面兩次無敵艦隊的覆轍。兩年前加里昂船隊在康沃爾郡的毛斯霍爾和彭贊斯一舉登陸成功，對腓力二世來說事記憶猶新的。因此，康沃爾郡的法爾茅斯港是他心中的第三次遠征目標。
當擁有6艘戰船的霍華德船隊在費羅爾港海域遊弋示威的時候，無敵艦隊總司令帕德拉爲了保存兵力，保守祕密，採取了非常明智的策略：對敵人的挑釁不予理睬。而以埃塞克斯爲首的英格蘭艦隊司令官們並沒有識破他的意圖，完全放鬆了本土的警戒體制。因此，經過充分準備的新的無敵艦隊如果充分發揮其戰鬥力的話，這次入侵英格蘭本土的作戰很有可能一舉成功。
帕德拉司令的監察官索托在7月4日才從費羅爾送給國王的信中報告：艦隊將於8月中旬出發，預計9月8日在英格蘭本土登陸。艦隊編制如下：23艘大型加里昂船、25艘小型加里昂船、26艘運輸船、數艘加來扎布拉斯船、約70艘登陸用的小型船，運載約兩萬名士兵，4000名水手。儘管如此，無敵艦隊的起航日期仍往後推了近一個月。
但途中不幸接連遭遇風暴，導致艦隊被吹散，計劃受挫，好在英國方面的艦隊也同樣被吹散了。而英國方面正當埃塞克斯和羅利的遠征艦隊(埃塞克斯-羅利遠征)無功而返時，無敵艦隊在法爾茅斯海域出現的消息，像驚雷一樣，使整個英格蘭陷入空前的慌亂之中。正在召開的議會解散了;發出了緊急命令，讓駐法蘭西的英格蘭遠征軍立即回國;在西部各郡頒佈緊急動員令;此外，還下令查塔姆基地女王直屬的加里昂船隊馬上出動;派羅伯特·克魯斯指揮正在多佛爾海域巡邏的船隊。在1587年和1588年對籌建中的無敵艦隊進行先發制人的攻擊時，伊麗莎白女王就十分擔心，艦隊主力不在國內時本土的防衛虛弱，而今她忐忑不安的憂患終於成了事實。
即使無敵艦隊僥倖在英格蘭本土登陸成功，也不可能從西班牙本國或荷蘭進行長期和連續的軍援補給。儘管腓力二世把希望寄託在英格蘭國內天主教徒及同情者的起義和支援上，但20餘年來，他們中的大多數人都已經成爲信奉新教的伊利莎白女王的順民。寄希望於佔領英格蘭本土一隅，以報加的斯慘敗之仇，纔是腓力二世的真實意圖。然而他的這個如意算盤終於隨第三次無敵艦隊遠征而破滅。
1599年第四次無敵艦隊遠征
年僅20歲就登上王位的腓力三世，決心繼承父王未竟的事業，堅持同英格蘭作戰。由於國王新喪，西班牙暫時停止了一切軍事行動。
到1599年服喪結束，帕德拉又立即着手編制第四次無敵艦隊遠征計劃，開展了轟轟烈烈的籌建工作。直到1599年7月第四次無敵艦隊終於湊齊，其艦隊擁有38艘蓋倫帆船和大型武裝航船，23艘加里船，50艘運輸船以及8000名士兵。身經百戰的海軍提督貝爾坦多納、布羅切羅等名將分別擔任艦隊的司令官參加遠征。
但伊麗莎白女王得到情報後立即下達緊急動員令，8月上旬英格蘭大部分主力艦船已進入臨戰狀態，最終因爲各種原因，第四次無敵艦隊終於沒有露面，而因荷蘭方面攻佔加那利羣島的阿斯帕爾瑪斯後，揮師北上開往亞速爾羣島，帕德拉臨時改變進攻英格蘭本土的計劃轉而保衛亞速爾羣島，最後造成無敵艦隊沒有前來進攻就白白浪費了他們寶貴的資金，做了一次無謂的緊急動員演習。
1601年第五次無敵艦隊遠征
從1601年春天起，西班牙比斯開灣沿岸流性傳染病，港口裝卸作業和造船廠全部停工，陷入癱瘓狀態。因此新的無敵艦隊的籌建地點改在里斯本，由布羅切羅和圖比亞伍爾二人指揮。第五支無敵艦隊比過去四支都小得多。艦隊的編制包括20艘加里昂船和數量相當的各種艦船，計劃運送4500名士兵和一定數量的攻城器械以及軍需品。
第五次無敵艦隊遠征的戰略意圖是運送4500名西班牙士兵在愛爾蘭登陸，同奧尼爾及其他愛爾蘭叛軍會師， 解放愛爾蘭全境。萬一未能成功，也必須確保愛爾蘭南部的各個據點;一旦登陸成功，艦隊將根據情況和需要，繼續負責運送軍需品的任務。
但很不幸的是，無敵艦隊再次遇上強烈的暴風雨，整支艦隊分崩離析，潰不成軍。殘餘的西班牙登陸部隊被英軍包圍在愛爾蘭的金塞爾。雖然頑強抵抗並一度給予英軍沉重打擊，但最終因彈盡糧絕，1602年1月3日金塞爾守軍指揮官阿基德拉向英軍投降。
當金塞爾守軍阿基德拉投降的消息傳到馬德里的時候，貝爾坦多納還準備再次率領無敵艦隊出發遠征，但因愛爾蘭遠征失敗和索托等人提出了和平建議，無敵艦隊才停止出動。自1588年以來，歷時13年的先後5次無敵艦隊遠征終於宣告結束。
後續發展
西班牙五次無敵艦隊遠征均告無果而終，不過英格蘭也因四次遠征(科倫納·里斯本遠征、1595-1596年西印度羣島遠征、1596年加的斯遠征、埃塞克斯-羅利遠征)和愛爾蘭的挫折元氣大傷，英西之間長期的海上角逐進入了低潮。
1601-1604年西班牙進行了人類史上較爲殘酷、血腥的奧斯坦德之圍，經過三年的圍攻，英荷聯軍最終投降，西班牙軍隊拿下了這座城堡，使英荷西三方都想結束戰爭，回到和平。1603年英格蘭新君詹姆斯一世繼位，他做的第一件事就是與西班牙國王腓力三世談判結束戰爭。1604年8月7日在加的斯灣，安東尼奧·奧肯指揮的西班牙艦船擊敗了英國的艦船。雖然戰鬥規模不大。但該戰鬥直接導致21天后英國與西葡帝國簽訂停戰條約。
英西戰爭並未像多數人所想的那樣，直至戰爭結束英格蘭未能確保對西班牙的海上優勢。西班牙的海上霸權一直持續到1639年唐斯之戰。
