張錫純治學雖多創論，然措詞婉轉，鮮直斥前人之非，與同道多友善，不好貶人貴己，不好大言傲人。中西醫論爭勢若冰炭時，仍本其夙志，撰文論中西醫理相通，醫界不宜作意氣之爭，人且以爲系中庸之道。但張錫純對誤人至死的庸醫卻當面斥之爲投井下石者，毫不留情。此雖激於義憤，亦可見其忠厚至誠，對患者極端負責。他處世爲學以“志誠”爲信條，書屋名“志誠堂”。
張錫純不避勞苦，自奉甚儉，常念學與年俱進，終生治學不輟。雖至晚年，每爲人合藥餌，必躬自監製;修訂著作及覆信答疑不肯假手他人。又力闢醫不叩門之說，每遇疑難重證，輒輾轉籌思，查考書籍，一旦有定見，雖昏夜立命車親赴病家調治。即或病在不治，亦勉盡人力，每救療至殮服已具，不肯稍有懈怠。時人稱之爲一代大師，實當之無愧。
張錫純成名較晚，而桃李半天下。及門弟子如隆昌周禹錫，如皋陳愛棠、李慰農，通縣高硯樵，祁陽王攻酲，深縣張方輿，天津孫玉泉、李寶和，遼寧仲曉秋等均爲一方名醫。私淑其學問者不可勝計。當時國內名中醫如漢口冉雪峯，嘉定張山雷，奉天劉冕堂，泰興楊如侯，香山劉蔚楚，慈溪張生甫，紹興何廉臣等均常與張錫純討論學術，爲聲氣相孚之摯友。近代影響較大的中醫雜誌多聘其爲特邀撰稿人。
衷中參西匯通中西醫的思想使張錫純找到全新的治學觀點和方法。第一是拋棄崇古泥古、固步自封的觀點，敢於創新，不全於故紙中求學問。從文獻出發匯通中西醫基本理論，並不足以解決當時的臨牀問題。這方面的與古爲新主要得益於他的第二種觀點和方法，即反對空談的觀點，崇尚實驗方法。張錫純雖無利用儀器進行實驗室研究的條件，而他卻能充分利用了自己長期臨證實踐的條件，盡一切可能通過切身體會去尋求知識。
張錫純的實驗精神突出表現在兩方面，一是對藥物的切實研究，二是臨牀的細緻觀察，以及詳細可靠的病歷記錄。他認爲，學醫的“第一層功夫在識藥性……僕學醫時，凡藥皆自嘗試”。自我嘗試仍不得真知，則求助於他人之體會。爲了研究小茴香是否有毒，他不恥下問廚師。其他藥物毒如巴豆、硫磺，峻如甘遂、細辛、麻黃、花椒等，均驗之於己，而後施之於人。對市藥的真僞，博諮周訪，親自監製，務得其真而後己。因此張錫純用藥之專，用量之重，爲常人所不及。特別是他反覆嘗試總結出萸肉救脫，參芪利尿，白礬化痰熱，赭石通腸結，三七消瘡腫，水蛭散症瘕，硫黃治虛寒下利，蜈蚣、蠍子定風消毒等，充分發揚了古人學說，擴大了中藥效用。他對生石膏、山萸肉、生山藥的研究，可謂前無古人。
《醫學衷中參西錄》全書逾百萬言，學者多感百讀不厭，關鍵在於其內容多爲生動詳細的實踐記錄和總結，而絕少鑿空臆說。其中張錫純自擬方約200首，古人成方或民間驗方亦約200首，重要醫論百餘處，涉及中西醫基礎和臨牀大部分內容，幾乎無一方、一藥、一法、一論不結合臨牀治驗進行說明。重要方法所附醫案多達數十例，重要論點在幾十年臨證和著述中反覆探討，反覆印證，不斷深化。因此，張錫純被尊稱爲“醫學實驗派大師”。
張錫純全書載案逾千，輕淺之病記載稍略，重病、久病或專示病案者，觀察記載無不詳細貼切，首尾完整。當時國內西醫病案及論文也多不及其著述資料翔實。文中以中醫立論者，必徵諸實驗;溝通中西者多發人深思。讀其書者或不能盡服其理，但必不以爲作者妄言欺人或故弄玄虛以湊篇幅。勤於實踐，切身體會，仔細觀察，隨時記錄，不斷整理提高，就是張錫純的實驗方法。
