馮厚敦隨後率千餘義軍與清軍巷戰，負傷力竭之後，對身邊的人說道：“爲我謝百姓，吾報國事畢矣!”隨即拔刀自刺其胸，又一頭跳入湖中尋死，後被清軍拖出。被俘之後，大英雄閻應元對清軍勸降的回答只有三個字：“速殺我!”終被清軍殺害。陳明遇關閉縣衙放火，將不願投降的男女大小共四十三人燒死，自己拿刀與清軍奮戰，最終握刀僵立倚靠在牆壁上，至死不倒。
訓導馮厚敦，身穿大明公服在明倫堂自縊而死。江陰百姓在英雄們的感召之下，依舊與清軍拼死巷戰，清軍瘋狂屠城，江陰男女老少赴水、蹈火、自刎、投繯者不計其數。由於起事到城破共計八十一天，史稱“江陰八十一日”。一些記載誇大了江陰八十一日的戰果，聲稱江陰義軍讓清軍陣亡“三王十八將”，是不符合史實的。
但江陰百姓的反清鬥爭堅持了整整八十一天，以城內死者九萬七千餘人，城外死者七萬五千餘人的重大犧牲，讓清軍付出了損失七萬五千多人的重大代價，舉世震驚、可歌可泣!至清朝乾隆年間，乾隆皇帝鑑於統治已經穩固，下令編纂《欽定勝朝殉節諸臣錄》和《欽定國史貳臣表傳》。對明末清初富有民族氣節的忠烈之士褒獎表彰，對叛國降清、奴顏婢膝的無恥之徒斥責鞭撻。
對領導江陰抗清的閻應元、陳明遇、馮厚敦三人分別賜予“忠烈”、“烈愍”、“節愍”的諡號，以示紀念。著名學者紀連海老師在講到江陰八十一日時，動情地說道：“因爲揚州十日是史可法帶領正規軍打的，是一個政權面對另一個政權的鬥爭，雖然也很了不起，但這是你政府的職責。
