大家都知道明朝名臣張居正在任內閣首輔十年中，實行了一系列改革措施，輔佐明神宗朱翊鈞開創了“萬曆新政”，使明王朝日益腐朽的統治逐漸有了復興的跡象。關於張居正，總是有兩種相反的觀點。有的人說他廉潔奉公，有的人說他中飽私囊;有的人說他賞罰分明、公正無私，有的人就說是偏袒親友、敵我分明。雖然張居正是褒貶不一的時局人物，但他確實是一心爲國，忠貞不二，他輔政期間的一些措施也確實起到了作用，革除了侵入大明王朝肌體的弊病。那麼爲什麼張居正死後遭到明神宗朱翊鈞的清算呢?
張居正死時，明神宗朱翊鈞已是近20歲的青年了。在痛哭流涕之餘，朱翊鈞隱隱約約也感到了些許的輕鬆。那位令人敬畏的張先生終於走了。不久，萬曆帝逐漸聽到了不少他原先根本無法聽到的言論。張居正的反對派開始試探性地放出風聲，旁敲側擊地把張居正的所謂種種罪行揭露出來，醜化其形象。朱翊鈞也在不知不覺中受到影響，原先那位令人敬佩的“張先生”的形象，已逐步在腦海中消失，代之而來的是欺君毒民、接受賄賂、賣官鬻爵、任人唯親、放縱奴僕、凌辱縉紳的奸臣形象。
於是明神宗朱翊鈞選擇先從張居正所謂的同黨馮保下手，籍沒馮保的家產。在馮保家中被抄出財物之多之精，大大出乎朱翊鈞的意料。既然太監馮保尚且能積下如此財物，那麼朱翊鈞自然有理由相信，張居正的家產肯定是一筆天文數字。聯想到張居正生前對他的那種“道貌岸然”式的嚴厲教育，以及由此而受的委屈和羞辱，朱翊鈞當時的心境是不難想象的。
再加之朱翊鈞早已耿耿於張居正的震主之威。當時很多人包括朱翊鈞的生母李太后將張居正比作漢朝的霍光，霍光是什麼人?要知道他可是做過廢立皇帝的事情的。據說，有一天朱翊鈞正在讀書，唸到“色勃如也”時，誤將“勃”讀成了“背”。突然聽見身邊一聲大吼：“這個字應該讀‘勃’!”張居正這一聲大吼，讓年幼的朱翊鈞真的有些“勃如”了。但礙於張居正當權，沒有發作。但從此之後，張居正在朱翊鈞心裏便不是敬愛，而是敬畏了。
從古代皇權與相權的關係上講，張居正輔政十年，大權在握，可張居正手裏的大權，說到底是明神宗朱翊鈞的大權。相權的膨脹必然是皇權的衰落。在權力上，張居正和明神宗朱翊鈞是對立矛盾的。張居正獨握大權，在明神宗朱翊鈞的心裏便是一種蔑視主上(篡權)的表現。這可是說是所有古代帝王的邏輯!那麼張居正死後，明神宗朱翊鈞拿回了本來就屬於自己的權力。
新時代的開啓，明神宗朱翊鈞心裏想的是：你們這些以前說張居正好的大臣，現在應該俯首帖耳，一致稱頌朕聖明瞭吧。我的所作所爲必定比張居正強，而且我要貶低張居正，抹殺張居正的功績，讓大臣們知道到底誰纔是高高在上獨攬大權的皇帝。於是，明神宗朱翊鈞開始尋找一種復仇的快慰。
最後，明神宗朱翊鈞下令抄張居正家，並削盡其宮秩，迫奪生前所賜璽書、四代誥命，以罪狀示天下，還差點刻棺戮屍。張居正的家屬餓死的餓死，自殺的自殺，流放的流放，逃亡的逃亡，落得可悲的下場。然而國難思良將。國衰思良臣。天啓二年(1622年)，明神宗朱翊鈞的孫子明熹宗朱由校在位時，爲激勵臣下，纔想起昔日的大功臣張居正，予以復官復蔭，然而一切俱已晚矣!
