柳生十兵衛三嚴在日本正史中有可能因爲身份低微而被驅逐出歷史，但是對於那些試圖填補他消失的那幾年間經歷的作者，藝術家和電影製作人來說則不然。
最早圍繞柳生十兵衛進行故事創作的是一本由日本作家山田風太郎於1967年著作的書《魔界転生》(從地獄復活)。書中描寫柳生十兵衛參與了1637和1638年的島原之亂。這個故事之後更於1981年被搬上大屏幕，由深作欣二執導。這個導演之後還導演了一部暢銷恐怖電影《大逃殺》。“魔界転生”還被漫畫家鳥羽笙子改編成漫畫，名字叫做《魔界転生：夢の跡》(從地獄復活：夢之標記)。這部漫畫之後又被改編成兩部動畫OVA(雖然原本的計劃是四部)：“魔界転生地獄變”。之後在美國發行的時候是以“忍者復活”的名字發行的。導演/作家川尻善昭在他的宏篇大作《獸兵衛忍風帖》動畫電影中，創造了主角人物牙神獣兵衛，以表示對柳生十兵衛的尊敬。在“侍魂”電子遊戲中，他的語音因其出現的不同場景而由酒井隆行或者小林清志配音。
柳生十兵衛還出現在其他的漫畫，動畫和電子遊戲中。這包括從敘事詩體裁的《“斬虎屠龍劍”》，青山剛昌的少年漫畫系列《城市風雲兒》，以及現代的模仿作品《柳生十兵衛(Jubei-Chan)》(講述一個現代的女孩子成爲具有300年曆史的柳生家族的繼承人)。還有幾部電影也是關於柳生十兵衛的，包括《於黑暗重生》以及《幕府武士》。這兩者都讓千葉真一飾演柳生十兵衛的角色。在格鬥遊戲“侍魂”(1，2，4，5，6和RPG)裏，柳生十兵衛是一個可操縱的人物，也是這一系列遊戲中少數幾個真實存在的人物之一。柳生十兵衛第二部登場的遊戲是“鬼武者” 視頻遊戲系列，但實際其實這個角色是他的祖父，柳生宗嚴。在鬼武者第四部遊戲中，一個姓柳生名茜的女性將柳生十兵衛奉爲她的家族最強的人，並且在執行一個跟蹤柳生宗矩的任務。在第一部遊戲最後的一個隱藏預告片裏，顯現的是一個戴眼罩的領頭人物，這表明柳生十兵衛原本是要作爲遊戲續集的主人翁的。 《武藏傳》則以柳生十兵衛留下來的少爲人知的歷史爲基礎編撰了一個虛擬的情節。
在現行的還在連載的動畫及漫畫《銀魂》中，柳生十兵衛被塑造成一個叫“柳生九兵衛”的獨眼女子，原型仍然是柳生十兵衛，其家庭背景也是相同，不過根據《銀魂》的劇情做了一定的調整和修改。在《銀魂》中，十兵衛仍然是一個劍術高強的武士。
十兵衛的一個有趣的方面是，在人們的印象中，他幾乎總是被描繪成老百姓的英雄。因此基本上所有關於他的作品裏都至少會有一個柳生十兵衛從過度驕縱的武士手中拯救無辜農民的場景(在十兵衛的時代，武士有權利在沒有任何理由的情況下殺掉農民，而且他們基本上不用爲此負擔責任，特別是在這些農民對武士有某些不敬的舉動時。)不過雖然柳生十兵衛富有一定英雄色彩，但是考慮到當時森嚴的階級制度，對於像十兵衛這樣一個屬於武士階層的人來說，英雄色彩是不太適合形容他的的。因此有很多推測針對人們對十兵衛的這種印象是如何產生的，要麼是十兵衛真人其事帶給其靈感，要麼就是作家和電影製片人爲了讓十兵衛更英雄化而導致的。
