日軍直接建立的慰安所相當普遍。日第15師團第67聯隊聯隊長鈴木啓久戰後供認，按照日軍的“慣例”，他下令在聯隊盤踞的5個地方(豐潤、沙河鎮及另外3個地方)建立了慰安所，並抓來60名中國婦女充當“慰安婦”。
京都16師團福知山20聯隊的老兵(是年76歲)證言，他們聯隊的慰安所是在軍隊指揮下經營的，“慰安婦”有日本人和朝鮮人，一個慰安所裏有15人左右。從白天到下午4時，一般是士兵進入的時間。從下午4時到晚上8時，是下士官(伍長、軍曹和曹長)進入的時間。8時以後則是軍官進入的時間。軍官如果沒有錢的話，幹完了事就回去，有錢的軍官則可以留宿。支付的是滿洲銀行、朝鮮銀行或日本銀行的錢。1941年2月，在開封的日軍第84野戰隊士兵戶村英雄寫到：“軍隊管理下的P屋(即慰安所)大約有五十間左右的房屋，此處居住的女人們……對象大都是將校和下士官。也有些將校軍官和這些‘戰時妻子’保持着臨時的無責任義務的關係。”這一資料現存於吉林省檔案館。
在戰火中建立的軍直營慰安所，依靠擄掠或強制徵用當地婦女建成，極爲野蠻。1938年初，日軍佔領上海不久，就大肆抓捕當地婦女，直接押送到北四川路(今四川北路)的虹口大旅社，門口有憲兵站崗，這裏成爲了日軍控制的慰安所，實際上這就是1996年聯合國人權調查委員會爲日軍慰安所定義的“合法的強姦中心”。有記錄指出，日軍於1938年設在北四川路橫浜橋相近某銀行的“行樂所”，“該屋各層有極暖之水汀，其最低一層，有日兵在無錫、浦東各地所擄之我國良家婦女，自十七、八歲者，約數百人，皆一絲不掛，面有愁容，而日兵則川流不息其間，任意選擇性的滿足。如任何女子有不從者，皮鞭立至”。
日軍不僅自己建立慰安所，還命令、唆使日軍與合作者籌建慰安所。根據武漢兵站司令部的慰安婦系長(股長)山田清吉的記載，兵站幹事藤井源治中佐副官和高橋慰安系長，強制接收漢口積慶裏的68戶住房，讓日本僑民建立12家慰安所，其他均是朝鮮人開設的慰安所。到1938年11月底，積慶裏慰安所已增加到30家;有日本“慰安婦”130名，朝鮮“慰安婦”150名，共280名。漢口慰安所的密集程度爲日軍佔領區所少見。
