崔日用進士出身，初爲芮城縣尉。
大足元年(701年)，武則天回長安，路經陝州。崔日用替刺史宗楚客盡心招待，得其讚賞，被推薦爲新豐縣尉，不久拜監察御史。
神龍元年(705年)，唐中宗即位。崔日用攀附宗楚客、武三思、武延秀等，得以驟遷兵部侍郎兼修文館學士。
景雲元年(710年)，中宗暴斃。崔日用擔心禍及自己，得知臨淄王李隆基要舉事，遂暗中結納，預謀兵變。李隆基發動唐隆之變時，命崔日用權知雍州長史事。之後以功授銀青光祿大夫、黃門侍郎，參知機務，封齊國公。任宰相月餘，與中書侍郎薛稷不合，兩人在中書省大吵，崔日用由是轉雍州長史，停知政事。不久出爲揚州長史，歷婺、汴二州刺史、兗州都督、荊州長史。
玄宗與太平公主素爲不睦，打算消滅公主一黨，遂跟崔日用討論，日用說：“太平公主謀逆有期，陛下往在宮府(太子)，欲有討捕，猶是子道臣道，須用謀用力。今既光臨大寶，但須下一制，誰敢不從?”並建議“先定北軍，次收逆黨，不要驚動太上皇”。先天二年(713年)七月初四，玄宗完全按照崔日用的計劃行事。遂誅太平公主。拜吏部尚書。後因事出爲常州刺史，削實封三百戶，轉汝州刺史。
開元十年(722年)，轉幷州大都督府長史。不久卒，時年五十，贈吏部尚書，諡曰昭。後又贈荊州大都督。
