戊戌年中，光緒的“忤逆不孝”令慈禧太后一度萌生廢黜皇帝的念頭，但最終因茲事體大及中外阻力而不得不自行放棄。但在次年(1899年)，慈禧太后宣佈“乙亥建儲”，即選中端親王載漪之子溥儁爲皇儲併入繼穆宗同治爲嗣，名號曰“大阿哥”。
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這事細說起來頗有些弔詭。因爲光緒時年不過28歲，爲何不待他生下子嗣，而急於爲同治立嗣，其中必有隱情。從惡意的角度來說，慈禧太后是爲了報復光緒而出此下策。但從善意的角度來說，也可有另種解釋。同治與光緒都是小皇帝出身，這對於朝政來說隱患頗多，因爲慈禧太后再精明，她也只是一個深宮中的女人，其學識和視野無法應對19世紀末的危機年代，而當時的朝廷上下，“國賴長君”(國家的昌盛需要有年長有經驗的君主進行管理)似乎也是一種共識。
但問題的關鍵在於，光緒皇帝似乎沒有生育能力。從目前公佈的醫案及光緒自述的“病原”來看，其自幼即體弱多病，而且患有長期的遺精病史。對於光緒的身體狀況，慈禧太后未必不是心知肚明。因爲隆裕皇后並非他人，而系她的親侄女。而且，光緒皇帝一生只有一後兩妃，之後便再也沒有冊封過其他嬪妃。這在清朝皇帝中絕無僅有。因爲通常而言，清朝皇帝的后妃至少在10人以上(如康熙甚至多達40人)。即便是19歲即去世的同治皇帝也有5名后妃。光緒只有一後二妃，這究竟是怎麼回事呢?
最合理的解釋是，光緒皇帝很可能因爲長期的腎炎等疾病而導致無生育能力(甚至性能力)，因此沒有了繼續冊封后妃的必要。如果這種推測符合事實的話，這不僅是光緒個人的殘酷命運，也可以說是清王朝的一種難言之隱，甚至可以說是致命的。在1856年同治出生之後，在近半個世紀的時間裏，皇宮中就再沒有新生兒的啼哭之聲。這對於清朝的國運來說，意味着什麼?
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宮荒50年，天要亡大清!
慈禧太后的出發點或許是好的。因爲皇帝是一個至爲高級而尖端的職位，任何有作爲的繼任者在之前都必須接受長期而專業的教育，一而再、再而三的小皇帝登基，無疑會引發越來越多的危機。眼看光緒確實生不出兒子，慈禧太后也只能另想辦法，早做打算。她最終在在皇親近支中選擇了端郡王載漪的次子溥儁爲大阿哥人選，即“皇儲”。
接慈禧太后的懿旨，溥儁系按當年吳可讀之議而入繼穆宗同治爲嗣，名號爲“大阿哥”。隨後，十五歲的溥儁被接到皇宮內弘德殿讀書，由同治的岳父承恩公崇綺和原同治的帝師大學士徐桐爲師傅。由此，在端郡王載漪周圍便聚集了一些保守頑固、盲目排外的親貴，如莊親王載勳、載漪的兄弟載濂和載瀾、軍機大臣剛毅、大學士徐桐等人。這些顢頇宵小之徒在庚子年胡搞一氣，結果引發了更大的一場災難。這就是爲人所熟知的“庚子國變”。在八國聯軍攻進北京後，慈禧太后等人逃到西安。一時間“國將不國”，清廷險些傾覆。
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吃了這樣一場大苦頭後，慈禧太后與光緒的關係有所改善。而端郡王載漪被認爲是“拳亂禍首”，由此連累“大阿哥”溥儁被廢出宮。皇宮雖然恢復了昔日的平靜，但帝、後之間的矛盾仍舊長期存在。在光緒的身體一日不如一日的煎熬中，如此又過了8年。
