公元1659年，南明大將鄭成功率領10餘萬軍隊北伐，開始了人生中規模最大的一次軍事行動。在這次戰役中，鄭成功的北伐軍保衛了東南地區的政治中心南京，形勢一片大好。但鄭成功最終並沒有拿下南京城，而是被清軍打得一敗塗地，北伐行動功敗垂成。那麼，既然擁有這麼大的優勢，鄭成功爲何沒有能夠拿下南京城呢?其實，這與鄭成功軍隊的整體配置有關。
一、鄭成功與南明永曆政權的關係很尷尬
在清朝入關以後，明朝並沒有立刻滅亡，而是出現了幾個藩王先後監國的情況，例如福王、魯王、唐王、桂王等等。福王朱由崧政權垮臺以後，魯王和唐王先後稱帝。鄭成功所屬的鄭氏集團，起初屬於唐王政權。在唐王政權滅亡以後，又隸屬於魯王政權。其實。桂王朱由榔已經在西南地區稱帝，但鄭成功對朱由榔的永曆政權，一直是尊而不授的態度。換句話說，鄭成功在名義上屬於永曆皇帝領導，但其實根本不服從永曆政權的調動。永曆政權的形勢原本岌岌可危，但依靠招撫大西軍將領李定國等人，永曆政權曾經前後兩次曇花一現。爲了打擊南明永曆政權，清朝把主要兵力和主要精力都用在西南方向。佔據廈門等地的鄭成功認爲這是天賜良機，鄭成功集中了主要兵力10餘萬人，開始了一場聲勢浩大的北伐行動，而且確實有成功的可能。
公元1659年6月，鄭成功率領大軍北伐，大軍從廈門出發，一路上攻佔了福建、浙江的部分沿海州縣。最終從長江出海口逆流而上，鄭成功的目標是南京城。南京是明朝的陪都，也是東南地區的經濟、軍事、政治中心，如果能夠攻下南京，全國的局勢將會發生很大的變化。6月底，鄭成功的軍隊已經兵臨南京城下。當時，南京城內的守軍只有幾千人，清朝的江寧將軍和兩江總督都非常焦慮。在上奏順治皇帝的奏摺中寫到：“海師二十餘萬，戰船千餘艘，俱渾身是鐵，箭射不透，刀斬不入。”南京城的構造是一個不規則體，對於防禦方來說，沒有充足的兵力很難堅守。但保衛南京10多天內，鄭成功沒有任何準備攻城的意思。鄭成功的軍隊擅長水戰，對於城市攻堅戰並不擅長，而是也缺乏比較的攻城器械。面對城牆堅固、高大的南京城，鄭成功並沒有把握。
二、鄭成功的北伐行動功虧一簣
面對堅固的南京城，鄭成功幻想着利用長期的圍困，迫使城內的守軍投降。鄭成功告訴將領們：“自古攻城掠邑，殺傷必多。所以未即攻者，欲待援虜齊集，必卜一戰，邀而殺之，管效忠必知我手段，不降亦走矣。況屬邑櫛次歸附，孤城絕援，不降何待?”經過一段時間的觀察，南京城內的清朝官員看透了鄭成功的打算，清朝官員們上演了詐降的計劃。一些清朝將領偷偷寫了投降書，表示“清朝的律法嚴苛，自己必須堅守一個月，否則全家都會被斬首。請鄭成功等待一個月，大家肯定會開城投降。”身經百戰的鄭成功從自身軍隊的特點考慮，選擇了等待清軍投降。其實，城內的清軍並沒有任何投降的意思，清朝軍隊要求城中百姓加固城牆，與此同時向順治皇帝彙報。得到南方的急報以後，清朝最高層命令安徽、蘇北、浙江等地的八旗軍和綠營軍向南京靠攏。
由於長時間的懈怠，北伐軍的鬥爭明顯下降，最前部的軍隊竟然開始在長江中捕魚。城內的清軍發現了這一點，開始進行試探性進攻，結果，鄭成功的軍隊一觸即潰。隨後，城內和城外的清軍開始夾擊北伐軍。在陸戰中，北伐軍遠不是滿洲八旗的對手。這次戰役中，鄭成功的北伐軍大敗虧輸，場景和當年宋太宗趙光義的北伐非常相似。鄭成功軍隊中的前鋒鎮、中衝鎮、援剿右鎮、後勁鎮、前衝鎮、左武衛鎮、左虎衛鎮、宣毅左鎮等部隊均遭受重創，或者被全殲，14位高級將領被俘或陣亡。經過計算，鄭成功損失了超過2萬軍隊，水師的實力已經大不如前。在十分無奈的情況下，鄭成功選擇了撤退。撤退的途中，鄭成功計劃攻下崇明島，鼓舞一下部隊的士氣。但一直沒有能夠攻下崇明縣城，再次暴露了部隊攻堅能力不足的問題，部隊的士氣更加低落。
三、鄭成功選擇攻取臺灣島，用於和清朝對抗
在南京的慘敗，讓鄭成功認識到清軍騎兵的厲害。在陸戰中，自己的部隊很難取勝。但僅僅依靠廈門等地，根本無法與清朝對抗。鄭成功想到了被荷蘭人佔據的臺灣島，公元1661年，也就是南京慘敗的兩年之後，鄭成功開始了攻取臺灣島的軍事行動。在這次軍事行動中，有一個問題是無法迴避的，還是軍隊攻堅能力的問題。鄭成功包圍了荷蘭人的城堡，但久攻不克。最後，鄭成功選擇了長期圍困。由於沒有援兵，鄭成功的圍困計劃奏效了，在被圍困了將近1年之後，彈盡糧絕的荷蘭人選擇了投降。在此之後，鄭成功開始利用臺灣島與清朝長期對抗。就在鄭成功控制檯灣島的同時，南明永曆政權到了最後的時刻，永曆皇帝朱由榔被殺，鄭氏集團成爲了明朝遺老們最後的依靠。永曆政權的一些殘餘力量，輾轉來到了臺灣島。
