黨務合流
一、組織中央特別委員會，統一黨務;
二、特別委員會由寧、漢、滬3方共同推定若干人組成;
三、寧、漢、滬3方中央黨部將其職權委託於特別委員會;
四、特別委員會除施行中央執行委員會全部職權外，應負責統一各地方的國民黨黨部，並籌備國民黨三大的召開;
五、規定特別委員會委員的名額32人，候補委員爲9人，具體人員由3方共同提出，由中央執行委員會臨時會議發表;
六、中央各部部長人選，由特別委員會決定。
政府合流
寧、漢兩方政府合併、改組，政府委員、各部部長、軍事委員會委員等，皆由特別委員會會議決定。會議推舉汪精衛、譚延闓、蔡元培、謝持共同起草統一宣言。
9月13日，武漢國民政府停止辦公，汪精衛通電下野。9月15日，在南京召開國民黨中央執行委員、中央監察委員臨時聯席會議，決定成立國民黨中央特別委員會，推定汪精衛、蔣介石、胡漢民等32人爲中央特別委員會委員，並決定勸蔣、汪、胡迅速來南京就職。9月16日，國民黨中央特別委員會在南京正式成立，並舉行第一次會議。
機構人事變更
一、推定汪精衛、蔡元培、謝持爲中央特別委員會常務委員;葉楚傖爲祕書長;各部不設部長，實行委員制，由各委員互選主任1人以統理黨務。
二、改組國民政府及軍事委員會。推定丁惟芬等47人爲國民政府委員會委員，以汪精衛、胡漢民、李烈鈞、蔡元培、譚延闓5人爲常務委員;推定於右任等67人爲國民政府軍事委員會委員，以蔣介石、汪精衛、胡漢民、譚延闓、唐生智、楊樹莊、李宗仁、白崇禧、李濟深、何應欽、馮玉祥、閻錫山、程潛、朱培德等14人爲主席團。
三、取消中央政治委員會及各地政治分會，其職權分別由國民黨中央黨部和省黨部、國民政府和省政府執行。
四、設立監察院。
最終結果
同時，發表了《中國國民黨特別委員會宣言》，宣告國民黨“統一”完成。9月20日，新產生的國民政府委員和軍事委員會委員在南京舉行就職典禮。國民政府發表成立宣言，宣稱：“本政府今後誓當竭智盡能，肅清共黨，以拯同胞永脫布爾什維克恐怖之禍，而保持國民革命勢力之統一。”實際上，寧、漢、滬3方合作很快又爲新的分裂所代替，出現了國民黨新軍閥混戰的局面。
歷史意義
當時在南京，有蔣介石控制的“國民政府”和“中央黨部”;在武漢，有汪精衛控制的“國民政府”和“中央黨部”。另外上海和各地都有一些軍閥把持的地方政權，但是主要以南京和武漢，蔣介石和汪精衛爲主。由於南京國民政府和武漢國民政府在反共問題上已沒有分歧，武漢漸有妥協趨勢。而南京的蔣介石在爭權奪利的鬥爭中處境漸顯不利，不得不以退爲進宣佈下野。蔣介石的下臺促使南京和武漢方面迅速靠攏，8月25日武漢國民政府遷往南京，南京國民政府同武漢國民政府合併，因南京簡稱“寧”，武漢簡稱“漢”，史稱“寧漢合流”。“寧漢合流”的實質：他們的階級利益是一致的。寧漢合流後的政府，仍稱南京國民政府。
