據《巴達維亞城日記》所記，料羅灣海戰被俘虜的荷蘭人約計百人。據福建巡撫鄒維璉奏報的戰績：“計生擒夷衆一百一十八名，馘斬夷級二十顆，焚夷夾版鉅艦五隻，奪夷夾版鉅艦一隻，擊破夷賊小舟五十餘隻，奪盔甲、刀劍、羅經、海圖等物皆有籍存。而前後銃死夷屍被夷拖去，未能割級者，累累難數，亦不敢敘。”
明朝方面，此場戰役之後原先對海禁政策採強硬態度的福建巡撫鄒維璉遭到撤職，繼任者對於海禁政策以及鄭芝龍等人無力約束採取放任態度，雖然明朝宣稱勝利，但東南海權自此落入鄭芝龍一人掌控。
料羅灣大戰後，明軍乘勝追擊，又連續與荷蘭人發生小規模海戰，一直將荷蘭趕出中國沿海爲止。而鄭芝龍則死咬劉香不放，“一破之於石尾，再破之於定海，三破之於廣河，四破之於白鴿，五破之於大擔，六破之於錢澳。”最後於崇禎八年(1635年)廣東海戰，將劉香逼得在決戰中自焚溺死。崇禎九年(1636年)鄭芝龍被任命爲福州都督，掌控了更大的權力，海盜問題也漸漸消失。
崇禎十二年(1639年)，荷蘭人再度派朗必即裏哥率大型戰艦9艘騷擾中國沿海，數次擊敗明朝水師的小型船隊，但最終又被鄭芝龍遣人攜帶盛滿火藥的竹筒泅水攻擊，一連焚燬5艘，朗必即裏哥大敗而回。直到此時，明鄭艦隊最終奪取了從日本到南海的全部東亞制海權，此時，鄭芝龍被稱爲“閩海王”，此後東南海疆唯鄭芝龍是從，來往內外商人皆用鄭氏旗號，史載：“每一舶例入三千金，歲入千萬計，並築城於安平(今福建省晉江市安海鎮)”。
當時凡航行在東亞地區的船隻，都必須花錢購買明鄭的令旗，若無此旗，在東亞海面被攔截的概率超過百分之五十，若在福建沿海，則百分之百被攔截。最後就連臺灣的荷蘭人都不得不偷偷地以日本船的名義購買令旗，當時中國東南沿海在明鄭和平的籠罩下正在平穩的發展。
荷蘭方面，東印度公司在此之戰明確認知其與明朝武力差距，放棄以武力方式解決與中國間的貿易問題，而鄭芝龍在戰後對荷蘭方面的善意回應使得荷蘭放棄與劉香等人的合作，轉回與鄭芝龍合作的貿易模式。荷蘭在此戰役對中國的損失絲毫不須賠償並且還得到了鄭芝龍方面穩定供貨保證。自此之後東印度公司與中國(鄭芝龍)方面維持穩定的貿易行爲直到明朝滅亡爲止。
