燕王朱棣後來起兵造事，把老子認命的孫子皇帝攆出南京的皇宮，至今下落不明，與朱允炆選擇的下葬時間失當有直接關係，成爲朱棣要搞他的第一理由。現在，關於朱元璋的死亡時間，有各種說法，一是洪武三十一年閏五月初九，一說是閏五月初五，一說是閏五月十七日等。爲什麼會有這麼多種說法，表面的原因是史書上記載多模糊，如《明史 惠帝紀》：“恭閩惠皇帝諱允蚊，大祖孫，懿文太子第;子也。
葬高皇帝於孝陵，詔行三年喪。”“辛卯”，現在可以確定了，就是洪武三十一年閏五月十六日。從這裏推算，朱元璋下葬是他死後的第七天，那麼死時間就是當年的閏五月初九。對於朱元璋到底是哪天死的?按說這是很清楚的事情，爲什麼史書上要寫得模糊?這與朱允炆給朱元璋選擇下葬時間不當，“嫌其太速，事理有不盡然者”，爲掩人耳目啊，故意混淆是非。
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現在史學界大多認爲，朱允炆確實是”速葬“了朱元璋。那朱允炆爲什麼敢冒天下之大不韙?有史書上稱，這是朱元璋自己選擇的時間，”故即位而葬，同日並舉，皆高皇遺命，正以速葬消諸。“而祕史更稱，朱允炆實際上在即位的前一天，即閏五月十五日把朱元璋給下葬了。這是”領命於地下“。這裏說明朱元璋擔心自己死後出亂子，留下遺言要朱允炆從速辦自己喪事的。而從天氣的角度考慮，速葬朱元璋也不無道理。
玩璋到底是哪天死的哪天葬的，下葬前到底發生了什麼?根據上面的文字和相關史料可以歸結如下，大概是朱允炆在朱元璋一閉眼，就想着即位的事情，而爲了不讓朱棣諸王回京找事，壞了自己的皇帝大夢，把朱元璋從速埋了，從速上位，並給各王發遺詔，不得回京奔喪。等等。那決定下葬後又發生了什麼?這同樣是一個謎團。
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在南京民間，連小孩子都知道這樣的傳說，朱元璋下葬那天出現了”迷魂陣“，就是南京的十三個城門同時出殯。此說法史書有記載，朱國楨的《皇明大政記》稱，朱元璋下葬那天”而發引，各門下葬“。爲什麼要這樣?在民間，有錢的大戶人家，爲了干擾視聽，防止有人盜墓，有意隱藏先人埋葬地點，而一個皇帝如此這般，實在令人不解。在元朝，帝王無陵寢，搞搞迷魂陣倒是很合乎情理，既然朱元璋生前都爲自己的歸宿找好了地方。
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據說當年孝陵內每到夜裏就傳出一個婦人的哭聲，原來這是馬皇后的哭聲，後來大搞法事纔沒有了哭聲。馬皇后爲什麼要哭?說是一人空守一座孤墳，悲傷所致啊，”後來孝陵傳夜哭，應緣馬後悲孤獨“，即是這個說法。葬在朝天宮這種說法，倒是給朱允炆”速葬“朱元璋、大擺迷魂陣、十三城門出殯找到了合理的解釋和可能性，朝天宮在城裏，速葬起來很方便的;如果葬在孝陵內，就沒有必要搞假象。
真相恐怕只有等到開挖明孝陵的哪一天才能最終揭開!但這個日子恐怕如開挖始皇陵一樣，目前還不可能，很遙遠，這也是說，朱元璋到底葬在哪，在相當長的時間內，仍將是一個謎!
