1908年11月14日晚，中南海瀛臺涵元殿陰森淒涼，經過了漫長十年的幽禁生活，傀儡皇帝光緒終於走到了自己人生的盡頭，結束了自己悲涼而充滿哀怨的一生。次日，實際統治中國達半個世紀的慈禧太后也死去了，前後只隔了一天。
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光緒的死亡充滿了無數謎團，因爲他與慈禧的死亡時間差太令人生疑了，光緒被慈禧囚禁十年，可以想象他對慈禧和曾經向慈禧告密的袁世凱有多麼的恨，當慈禧自己知道時日無多時，但袁世凱知道光緒馬上要上臺處理自己的時候，難免有可能先下手爲強。
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光緒去世後葬於河北易縣清西陵的崇陵，這個可憐的人死後並未得到安寧，下葬25年後，崇陵地宮被人盜掘，光緒遺體被拖出棺外，身上穿着的衣物已經腐爛得比較嚴重，身上的隨葬裝飾物品已被盜竊一空。
1980年，光緒的屍骨重新安置於地宮的棺槨裏，但他的髮辮、部分遺骨保存在庫房中。
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爲了切實的找出光緒的死因，2003年，光緒帝的兩小縷頭髮被送到中國原子能研究院，接受現代技術的檢驗。
結果發現他的頭髮砷含量爲2404微克/克，高出葬在他旁邊的隆裕皇后的261倍，2008年，歷時五年，多個研究機構出具的《清光緒帝死因研究工作報告》出爐，報告中明確指出光緒皇帝系因砒霜中毒死亡，光緒死因這樁百年來的疑案終於得以確認。
