卜彌格出身望族，父親是波蘭國王的御醫，他家學很好，對醫學有很深的研究。1643年，他離開里斯本前往東方——當時來華的傳教士，都必須從里斯本出發，因爲當時的東方護教權是由葡萄牙負責的，往大西洋、往美洲是由西班牙負責的。1644年卜彌格來到澳門，學習了漢語，1647年到海南島去傳教。
1644年北京的明朝政權覆亡之後，南方又擁立了一個小朝廷南明王朝，最後一個皇帝是永曆皇帝。當時局勢十分危險，1651年永曆皇帝決定派遣卜彌格作爲南明王朝的特使返回歐洲，向羅馬教廷求救。當時羅馬教廷仍然是歐洲很重要的一個力量。現在看起來這是一個非常可笑的事，南明王朝危機了，跑到幾萬裏之外的羅馬去搬兵——但正是這麼一個活動，促使了中國與歐洲的第一次正式的外交接觸，很多人說中國與西方世界的接觸是康熙年間的《尼布楚條約》，實際上在這之前就有卜彌格出使羅馬。
卜彌格回到羅馬，非常不受重視，因爲明清鼎革的局勢很複雜，耶穌會對中國的政治判斷也非常狡猾。當時中國有三個政權——清朝、南明王朝，張獻忠的部隊也還沒有完全被打敗。張獻忠地盤上有兩個傳教士，安文思和利類思;清軍進關以後在北京留下的有湯若望;隨着南明王朝南遷的兩個傳教士，是瞿微紗(AndréKoffler，爲清兵所殺)和卜彌格。耶穌會派了衛匡國(MartinMartini)回到歐洲告訴梵蒂岡，說卜彌格代表的南明王朝基本上完了，所以梵蒂岡一直不接見他，拖了他整整三年多。他穿着明朝的衣服幾次要求覲見，最後教廷還是禮節性地見了他，把他打發走了。當時他帶回西方的一些材料，全部放在羅馬的耶穌會檔案館。
卜彌格1656年離開了歐洲，帶着當時的教宗給永曆皇帝的母親王太后和太監龐天壽的信回中國。1658年他到了澳門，很倒黴，當時清軍已經完全佔領了廣州，澳門當局害怕接待這位南明特使後，清兵對澳門不利，就拒絕他進入澳門。他沒辦法只好又返回安南(現在的越南)，希望從陸路回到中國。他一路勞頓，終於病倒，就病死在越南和廣西的邊界線上。他一生都是在爲南明王朝服務。他走的時候帶了兩個小修士，其中一個叫陳安德，一直跟着他，最後把他草草地埋在了中越邊界線上。
