董晉在唐玄宗後期中明經科，唐肅宗即位後，被任命爲祕書省校書郎，供職翰林。之後，還任過汾州司馬、淮南節度使崔圓的判官，及主客員外郎等職。
唐代宗大曆年間(766—779年)，董晉曾隨同李涵護送崇徽公主嫁回紇，因不辱使命，回朝後拜司勳郎中，後遷轉祕書少監、左金吾將軍等職。
唐德宗即位後，董晉先在朝廷太府卿、御史中丞，後外任華州刺史。這時，四鎮之亂爆發，前往平亂的涇原鎮兵路經長安時發生譁變，德宗逃往奉天(今陝西乾縣)。涇原變兵在長安擁立朱泚爲主。朱泚派兵攻華州，董晉棄城赴奉天跟從德宗，被封爲國子祭酒。不久，董晉出使撫慰恆州，回經河中時，節度使李懷光也起兵反叛朝廷，並與朱泚相呼應。董晉在河中對李懷光曉以君臣大義，勸他不要助朱泚爲亂。李懷光聽從董晉的勸說，雖不滿於朝廷，但終不與朱泚相勾結，這對當時的政局產生了積極的影響。
奉天之難平定後，德宗返回京師，董晉遷任左金吾衛大將軍、尚書左丞，當時韓滉執政，威權顯赫，韓滉仗勢陷害右丞元琇，雖朝臣都認爲元琇冤枉，但懾於韓滉權勢敢怒而不敢言。董晉挺身爲元琇極力辯解，頗爲朝臣歷稱道。
貞元五年(789年)三月，董晉爲門下侍郎、同中書門下平章事(即宰相)。因另一宰相竇參正得寵於德宗，大權獨攬，董晉但奉職而已。竇參專政，引起了德宗的猜忌。唐德宗向董晉詢問竇參的過失，董晉如實作了回答，德宗於是罷免了竇參。董晉心感到惶恐，上疏辭職。
貞元九年(793年)，董晉被起用爲禮部尚書兼兵部尚書、東都留守、東都畿汝州都防禦使。
不久，宣武(今河南開封)節度使李萬榮死，德宗授董晉爲尚書左僕射、同中書門下平章事，兼宣武節度副大使。本來李萬榮臨死前已讓同鄉親信鄧惟恭接任，這樣，鄧惟恭對董晉的來任非常不滿，以至發展到謀圖反叛。董晉得知後捕殺其黨羽，囚送鄧惟恭到京師，德宗對鄧惟恭將功折罪流放汀州，但又怕董晉柔弱不能制御宣武的驕兵悍將，調汝州刺史陸長源爲其司馬管理軍務。陸長源執法嚴刻，多追究鎮兵的往日惡行。董晉開始支持他，後來見這樣不利於與鎮兵的關係，就制止他的作爲。董晉又用孟叔度管理財賦，而孟叔度爲人輕佻，不尊重鎮兵，爲鎮兵所反感，雖然如此，因董晉謙虛謹填，儉約循舊，使鎮兵還大體安定。
貞元十五年(799年)二月三日(3月13日)，董晉在宣武軍去世，終年七十六歲。德宗爲他輟朝三日，追贈太傅，諡號“恭惠”。董晉死後不到十日，宣武即發生兵亂，亂軍虐殺陸長源及孟叔度。
主要成就
縱觀董晉一生，其才能表現是多方面的：他出使回紇不辱使命;在韓滉權盛時，挺身而出爲元琇辨解;在四鎮之亂時遊說李懷光不叛朝廷;在宣武時，平息鄧惟恭之亂，井撫御其驕兵悍將。
逸聞趣事
唐德宗時，董晉和竇參一同爲相。所有的大事都由竇參決定，董晉唯唯服從。竇參逐漸自滿傲慢，德宗不滿意他。竇參囑咐董晉，要他向皇帝奏請給事中竇申做吏部侍郎。德宗嚴肅地說：“這是不是竇參的主意?董晉不敢隱諱，以實話相告。德宗就問竇參的過失，董晉一一回稟。不久，竇參便被貶官。董晉也數次上表請辭，德宗於是將其罷相，改授兵部尚書、東都留守等職。適逢宣武軍節度使李萬榮病重，他的兒子作亂。朝廷就任命董晉爲汴州節度使。董晉受命後，僅帶隨從十幾個人，直赴鄭州。汴州(宣武軍首府)方面並未派人出迎，董晉的部下和鄭州官吏都很害怕，都勸他說：“汴州節度府的都虞侯鄧惟恭是應該來迎接的。他不僅沒有來，還乘着李萬榮病重，攫取了兵權。現在節度使到了這裏，他還不來迎接你，他的想法已經很明白了。恐怕咱們得暫時迴避一下，以便等待時機。”董晉說：“我奉命做節度使，只能按時到任，怎麼可以逗留不前?”大家都擔心他有危險，唯獨董晉自己恬然自處。到了離汴州幾十裏的地方，鄧惟恭纔來迎接。董晉看到鄧惟恭連馬都沒下，記在心裏。到了節度衙門，仍然讓鄧惟恭主持軍務。鄧惟恭只知道董晉是朝廷派來做節度使的，但摸不清他會怎樣做。
鄧惟恭本以爲他自己應當接替李萬榮做節度使，故意不派人接董晉，企圖讓他害怕，希望董晉不敢到汴州來，沒有想到董晉會來得這樣神速。董晉這麼快地來了，臨近了汴州，鄧惟恭只好去迎接，但心裏懷着鬼胎。董晉以鄧惟恭傲慢無禮，圖謀不軌的罪名，把鄧惟恭發配到嶺南。朝廷擔心董晉柔弱，又派汝州刺史陸長源任宣武行軍司馬，協助他管理軍務。董晉性格寬厚，待人謙和。每次行事，大多按照舊例辦理，使軍心逐漸安定。陸長源爲人嚴苛，請求按照自己的意思處理。董晉總是在開始答應，待到陸長源擬好方案後，又扣下不用。董晉委任節度判官孟叔度管理錢糧，此人爲人輕浮，不尊重士卒，遭到衆人記恨。董晉逝世後十日，汴州大亂，亂軍殺死了陸長源和孟叔度，並且把他們的肉煮成粥來吃。
